沉香自古以来除做为香材外，最重要的是它的药用疗效，十八九世纪欧洲人进入东南亚，及南中国大量收集沉香，曾一度为痛风    与风湿关节炎的特效药而大大宣传，这是非常有需要的配伍用药。
    
    沉香有通关开窍、畅通气脉、养生治病等神奇功效，历来是一味重要的药材，中医典籍的相关记述甚多，如《本草备要》谓之“能下气而坠痰涎，能降亦能升，气香入脾，故能理诸气而调中，其色黑。体阳，故入右臂命门，暖精助阳，行气不伤气，温中不助火。”在主治方面，《本草备要》记载：“心腹疼痛，噤口毒痢，征癖邪恶，冷风麻瘅，气痢气淋。”
    
    《大明本草》谓之“调中补五脏，益精壮阳，暖腰膝，止转筋吐泻冷气；破征癖冷风麻痹，骨节不任风湿，皮肤发气痢。”《本草纲目》谓之“能冶上热下寒，气逆喘急，大肠虚闭，小便气淋，男子精冷。”
    
    以上古代的典籍的记载来看，首先便指出在呼吸系统的气喘而逆上，上气接不住下气，并且能化痰涎而出，对老年虚弱的气喘是特别有效的，一般可配附子，肉桂，乾姜，五味子各一钱，水煎调服沉香末一克，可达迅速止喘之效果。
    
    气香入脾，对于消化系统而言，沉香是上好的药材，因它暖胃通气，所以是温胃行气药当中的极品，它能治一切气分不调之症，凡是因为气滞所引起的肋间神经痛，胃肠胀痛，呃逆，喘促都可以用沉香末冲服而达致疗效，极为有效的。
    
    胃肠的毛病通常是由肠胃神经不协调而形成的。在中医学上称为[肝木克脾]的现象，造成胃肠的消化不良，也就是[气分]不调而造成的，在急性的胃肠胀痛上，尤其是本来就犯有慢性消化道疾病的人，便可利用沉香的苦辛温性味，达成[暖胃温脾，通气定痛]的效果了。 木雕工艺品。
    
    因为胃肠胀痛是肠胃病的常见现象，沉香是最天然的生药材，沉香具有强烈的抗菌效能，这种特性使得沉香治疗胃肠胀痛和对于妇女的月经期内腹痛极为有效，因此自古以来沉香就是极为珍贵的药材。
    
    沉香的香气能行气理气，所以其主要的功效是祛除体内“恶气”，所谓杀精鬼气，因此沉香自然能调节体内气的运行，对身体上的肝、心、脾、胃、肾、肺部的疾病，都是极为重要的药材。
    
    有的沉香在燃烧之前，几乎没有任何香味，不过在燃烧时就会产生清凉的香味，这种香味会宁心定志，使紧张的情绪放松，不仅对容易失眠的人，能辅助入眠，还可以因为大脑得到良性的休息，而增加学生大脑效能，进而提升了记忆力，注意力和理解力。
    
    根据药典记载，沉香的香味是香中之王，是最具有治疗效果的天然材料，所以有人说只要闻过奇楠香香味的人，这辈子就没有白活了，这是因为沉香不仅是能作为“香”，还在闻香过程中得到了健康，沉香是真正的价值珍贵香品。